Zunächst hatte er sich der Forschung gewidmet und als wissenschaftlicher Mitarbeiter am Fachgebiet Finanzwissenschaft der TU Darmstadt gearbeitet. Dort hat er auch promoviert.

Danach stieg Setzer bei der Deutschen Bank ein und wurde 2000 zum Chief of Staff der Abteilung Global Technology & Services ernannt. Rund drei Jahre später übernahm er das globale IT-Management des Bereichs Privat- und Geschäftskunden. Von 2004 bis 2008 verantwortete er außerdem den Bereich Operations Management für die Privatkunden-Sparte.

Verantwortlich für die Postbank-Integration

In seiner aktuellen Funktion als Managing Director im Bereich Global Technology & Operations war Setzer unter anderem für die Integration der Postbank-IT zuständig. Die Deutsche Bank hatte sich Ende 2010 die Mehrheit an der Postbank gesichert.